Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
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PTPRMP28827 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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PTPRMP28827 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRMP28827 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRMP28827 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
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PTPRMP28827 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRMP28827 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRMP28827 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRMP28827 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRMP28827 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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PTPRMP28827 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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PTPRMP28827 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
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PTPRMP28827 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
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PTPRMP28827 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRMP28827 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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PTPRMP28827 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRMP28827 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRMP28827 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRMP28827 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRMP28827 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRMP28827 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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PTPRMP28827 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRMP28827 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRMP28827 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
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