Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPREP23469 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPREP23469 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPREP23469 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPREP23469 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPREP23469 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPREP23469 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPREP23469 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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