Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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PTPRDP23468 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRDP23468 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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