Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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USP17L18D6R9N7 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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USP17L18D6R9N7 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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USP17L18D6R9N7 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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USP17L18D6R9N7 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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USP17L18D6R9N7 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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USP17L18D6R9N7 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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USP17L18D6R9N7 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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USP17L18D6R9N7 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USP17L18D6R9N7 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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