Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IRGMA1A4Y4 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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