Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
SH3BP4Q9P0V3 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms