Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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FOXQ1Q9C009 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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FOXQ1Q9C009 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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FOXQ1Q9C009 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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FOXQ1Q9C009 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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FOXQ1Q9C009 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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