Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SPOCK3Q9BQ16 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SPOCK3Q9BQ16 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SPOCK3Q9BQ16 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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SPOCK3Q9BQ16 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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SPOCK3Q9BQ16 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPOCK3Q9BQ16 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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