Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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MEIS3Q99687 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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MEIS3Q99687 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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MEIS3Q99687 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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MEIS3Q99687 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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MEIS3Q99687 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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