Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRERF1Q96PN7 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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