Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CFAP47Q6ZTR5 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms