Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TPRNQ4KMQ1 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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