Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPROQ16827 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPROQ16827 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms