Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ME3Q16798 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ME3Q16798 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ME3Q16798 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ME3Q16798 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ME3Q16798 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ME3Q16798 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ME3Q16798 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ME3Q16798 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ME3Q16798 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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