Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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