Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

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Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
ZFHX3Q15911 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZFHX3Q15911 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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