Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms