Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SMCO1Q147U7 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
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