Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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DDX39BQ13838 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DDX39BQ13838 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
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DDX39BQ13838 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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DDX39BQ13838 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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DDX39BQ13838 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
DDX39BQ13838 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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