Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ATP1A4Q13733 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ATP1A4Q13733 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ATP1A4Q13733 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ATP1A4Q13733 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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