Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRR1Q13601 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms