Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HDAC1Q13547 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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