Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRQ13535 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRQ13535 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRQ13535 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.19□□□□□ -2.38
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