Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXE3Q13461 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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