Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
XRCC4Q13426 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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