Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATMQ13315 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ATMQ13315 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
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ATMQ13315 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ATMQ13315 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ATMQ13315 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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