Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SRSF6Q13247 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SRSF6Q13247 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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