Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NUP160Q12769 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.7 ms