Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA13P31271 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms