Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CRXO43186 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CRXO43186 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CRXO43186 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CRXO43186 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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