Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms