Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM10Q9NQV6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM10Q9NQV6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms