Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim39Q9ESN2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Trim39Q9ESN2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim39Q9ESN2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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