Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

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Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rapgef4Q9EQZ6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rapgef4Q9EQZ6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms