Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9DA42 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9DA42 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9DA42 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DA42 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9DA42 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9DA42 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9DA42 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9DA42 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9DA42 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9DA42 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DA42 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms