Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIRIP3Q9BW71 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms