Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms