Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cdca3Q99M54 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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