Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Col6a6Q8C6K9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Col6a6Q8C6K9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Col6a6Q8C6K9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Col6a6Q8C6K9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col6a6Q8C6K9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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