Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnih3Q6ZWS4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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