Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUSD1Q6UWL2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUSD1Q6UWL2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms