Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Pydc3Q3V3Q4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Pydc3Q3V3Q4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Pydc3Q3V3Q4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pydc3Q3V3Q4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Pydc3Q3V3Q4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Pydc3Q3V3Q4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Pydc3Q3V3Q4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pydc3Q3V3Q4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pydc3Q3V3Q4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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