Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABP4P57796 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABP4P57796 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABP4P57796 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABP4P57796 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABP4P57796 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABP4P57796 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABP4P57796 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABP4P57796 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABP4P57796 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CABP4P57796 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CABP4P57796 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms