Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ggta1P23336 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ggta1P23336 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ggta1P23336 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ggta1P23336 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ggta1P23336 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ggta1P23336 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ggta1P23336 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms