Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja1P23242 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja1P23242 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms