Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r76F8VQ63 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r76F8VQ63 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms