Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930447F04RikA2AFR2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms