Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1Q9NPL8 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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