Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms