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| TMX3 | Q96JJ7 | U6.99-201 | ENST00000637524 | 83 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | ATP2B1-201 | ENST00000261173 | 6777 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR369-201 | ENST00000362155 | 70 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | Y_RNA.128-201 | ENST00000363391 | 112 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | Y_RNA.395-201 | ENST00000383945 | 109 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-306P-201 | ENST00000384617 | 107 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | Y_RNA.670-201 | ENST00000516255 | 105 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | AC009271.1-202 | ENST00000588803 | 492 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | LINC01897-203 | ENST00000591503 | 369 nt | TSL 2 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC009229.3-201 | ENST00000608056 | 282 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC133104.2-201 | ENST00000615272 | 193 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC244517.12-201 | ENST00000623581 | 663 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SNORA50A-202 | ENST00000629536 | 136 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | U6.105-201 | ENST00000637379 | 88 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR622-201 | ENST00000638396 | 96 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | NEB-201 | ENST00000172853 | 20634 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | ZNF280C-201 | ENST00000370978 | 4634 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | LPP-221 | ENST00000618621 | 18277 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | LPP-222 | ENST00000640853 | 18277 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MTND5P10-201 | ENST00000603719 | 1809 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL445259.1-201 | ENST00000587106 | 2984 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | Y_RNA.151-201 | ENST00000363566 | 112 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-270P-201 | ENST00000364131 | 105 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SNORA51.4-201 | ENST00000364993 | 124 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | Z98749.2-208 | ENST00000381646 | 500 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU1-73P-201 | ENST00000383971 | 164 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-474P-201 | ENST00000384243 | 107 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR183-201 | ENST00000384958 | 110 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL030996.1-201 | ENST00000411430 | 235 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | HMGN2P30-201 | ENST00000423237 | 256 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | ZFY-AS1-202 | ENST00000431145 | 419 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RPS29P6-201 | ENST00000438196 | 145 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | LINC01510-203 | ENST00000458082 | 626 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RPL23AP45-201 | ENST00000476406 | 468 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC006445.2-201 | ENST00000510061 | 472 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC113155.1-201 | ENST00000511141 | 769 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-928P-201 | ENST00000516876 | 104 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-1183P-201 | ENST00000517054 | 60 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AP003715.1-201 | ENST00000532109 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | EAF1-AS1-207 | ENST00000599742 | 772 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | PISRT1.1-201 | ENST00000616930 | 107 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | HOXA11-AS1_4.1-201 | ENST00000620901 | 233 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC138627.2-201 | ENST00000624202 | 601 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC068544.1-201 | ENST00000635064 | 248 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | ADAMTS9-AS1-207 | ENST00000594810 | 3609 nt | TSL 4 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AF165147.1-201 | ENST00000433310 | 6103 nt | TSL 2 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | GRAMD1C-202 | ENST00000440446 | 3475 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | PRKACB-219 | ENST00000614872 | 4306 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MTCO1P12-201 | ENST00000414273 | 1543 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR133A1HG-202 | ENST00000581072 | 4226 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | HSPA4L-202 | ENST00000505726 | 2639 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-884P-201 | ENST00000363889 | 107 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | DYNLT3P1-201 | ENST00000378574 | 347 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-72P-201 | ENST00000384285 | 79 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-658P-201 | ENST00000384606 | 106 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR517A-201 | ENST00000385001 | 87 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR181B1-201 | ENST00000385240 | 110 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | HIST1H2APS3-201 | ENST00000403259 | 134 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL590004.1-201 | ENST00000405321 | 300 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RPL5P18-201 | ENST00000406671 | 891 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC010731.3-201 | ENST00000415029 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL117339.3-201 | ENST00000418733 | 162 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC093151.1-201 | ENST00000427711 | 313 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | USP9YP30-201 | ENST00000430729 | 455 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL024508.1-201 | ENST00000432477 | 505 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC236972.1-201 | ENST00000433225 | 199 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RPL37P4-201 | ENST00000448908 | 268 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL353148.1-201 | ENST00000449761 | 463 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | Y_RNA.631-201 | ENST00000459607 | 101 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC097473.1-201 | ENST00000508142 | 408 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | HTN3-202 | ENST00000526767 | 578 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC011494.1-201 | ENST00000596454 | 237 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SNRPGP17-201 | ENST00000603780 | 214 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL161629.2-201 | ENST00000615347 | 275 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |